Алиментарную дистрофию зимы 1942 года и ранней весны 1943 года сменяют туберкулез, пневмонии, вирусный гепатит. Начали нарастать заболевания сердечно-сосудистой системы. Возникала эпидемия «Ленинградской гипертонической болезни». Из «Дневника» В. Г. Гаршина: «Поздней осенью 1942 г., когда мы уже изживали голодную болезнь, состав больных в наших больницах стал меняться. Во время голода сердечных больных почти не было. Осенью количество их стало нарастать. Это начали сдавать ленинградские сердца. До войны умирало 3–4%. А теперь 40–50%!»

Из «Дневника» В. Г. Гаршина: «На вскрытии больше гипертрофированные сердца… Сжались сосуды, сузились мелкие артерии всего тела. И чтобы протолкнуть кровь через эти суженные сосуды, чтобы дать тканям необходимое количество крови, сердце работает все сильнее, оно поднимает давление внутри сосудов. Ткани теперь получают достаточно крови, но сердце из-за этого увеличивается, как любая мышца при повышенной работе. По основному признаку — по повышенному давлению — эта болезнь называется гипертонической. В ее основе лежит постоянное сужение сосудов. ‹…› это сосудистый невроз. Здесь, в Ленинграде, за два с половиной года осады, этот фактор выступил с особенной яркостью. Я думаю, что ленинградский „эксперимент“ (постоянная опасность, работа под обстрелом, потеря близких, ужасы голода, бомбежек, главное — длительно и без передышки) в значительной мере решил проблему гипертонической болезни.
Повышенное давление меняет не только сердца, но и сосуды, особенно сосуды мозга и почек. Кровоизлияния в мозг, мозговые удары — это результат гипертонической болезни, равно как и некоторые поражения почек. Но они пришли позднее, уже в середине 1943 года».

Заведующий кафедрой патологической анатомии 1 ЛМИ (1944–1952) В. Г. Гаршин понял, какой важный для последующих поколений материал сосредоточивается в руках его малочисленного коллектива, и работал с возрастающим напряжением. В декабре 1943 года он провел пять научно-практических конференций, посвященных патоморфологии инфекционного гепатита, особенностям поражения сердца у больных артериальной гипертензии и перенесенной ранее алиментарной дистрофии, выступил на конференции врачей Ленинградского фронта по вопросам патологической анатомии огнестрельных остеомиелитов и прогрессирования туберкулеза после ранений. Деятельность В. Г. Гаршина в блокадном Ленинграде была отмечена правительственной наградой.