В Санкт-Петербургском женском медицинском институте кафедра госпитальной хирургии была открыта осенью 1901 года или через 4 года после его основания. К этому времени слушательницы прошли начальное обучение по хирургии на кафедре общей и факультетской хирургии и, выражаясь словами Н.И.Пирогова, возникла необходимость «научить студента разбираться в диагностике и лечить больных, используя для этого те знания, которые он приобрел на протяжении всего периода обучения».

Первым заведующим кафедрой и директором клиники госпитальной хирургии в течение 17 лет был профессор Александр Александрович Кадьян (1849-1917). Он был талантливым организатором, общественным деятелем, умелым хирургом, прекрасным педагогом, разносторонним ученым. Особенно известны его труды по сепсису, перитониту, травме живота и грудной клетки.

В 1917 году кафедру и клинику возглавил профессор Николай Николаевич Петров (1876-1964) – основоположник отечественной онкологии. В 1926 году он по поручению Ленинградского Губздравотдела организовал и возглавил Онкологический институт, которым руководил до 1963 года.

Последующие 23 года кафедрой руководил Иустин Ивлианович Джанелидзе (1883-1950). При нем в клинике стали разрабатываться новые направления в хирургии, а именно: сердечно-сосудистая хирургия, хирургия легких.

В 1950 году, после смерти И.И.Джанелидзе, кафедру возглавил профессор Федор Григорьевич Углов. В связи с этим лечебная и научная работа на кафедре и в клинике госпитальной хирургии была еще в большей степени переориентирована на освоение  актуальных проблем грудной хирургии (хирургии средостения, сердца, аорты и крупных сосудов, легких, пищевода). Он впервые в стране осуществил операцию наложения порто-кавального анастомоза при портальной гипертензии, одним из первых стал выполнять резекцию легких, резекцию пищевода при раке его средней трети с наложением внутригрудного анастомоза, а также уникальные операции при врожденных и приобретенных пороках сердца. По инициативе Ф.Г.Углова в 1966 году был построен новый корпус клиники госпитальной хирургии.

В 1972 году на базе госпитальной хирургии были созданы две самостоятельные кафедры: кафедра госпитальной хирургии V курса и кафедра госпитальной хирургии для субординаторов, которую возглавил профессор Ф.Г.Углов (в дальнейшем с отменой субординатуры по хирургии в 1996 году они получили новые официальные названия: кафедра госпитальной хирургии №1 и кафедра госпитальной хирургии №2 соответственно).

После прошедшей реорганизации кафедру госпитальной хирургии №1 возглавил профессор Николай Васильевич Путов, известный ученый в области грудной хирургии, один из ведущих хирургов-пульмонологов нашей страны. Основные научные исследования профессора Н.В.Путова были посвящены вопросам раневой патологии, хирургии врожденных и приобретенных пороков сердца, а также легочной патологии.

С 1993 года заведующим кафедрой госпитальной хирургии №1 стал профессор Анатолий Михайлович Игнашов. Он продолжил развитие в клинике сосудистой хирургии, особое внимание при этом уделялось окклюзионным поражениям брюшной аорты, непарных висцеральных артерий.

В 2004 году кафедру госпитальной хирургии №1 возглавил  академик РАМН, профессор Николай Антонович Яицкий. Профессор Н.А. Яицкий длительное время (с 1988 по 2008 год) был ректором СПбГМУ им. акад. И.П.Павлова, а в настоящее время является президентом нашего Университета.  Он постоянно ведет активную научно-исследовательскую, преподавательскую и лечебно-диагностическую деятельность в области клинической онкологии. Основным направлением его исследований является разработка современных методов диагностики и лечения заболеваний ободочной и прямой кишки.